El río Besaya en Cantabria nace en los terrenos de Fresno del Río y la primera localidad por la que pasa es Cañeda (Campoo de Enmedio, Cantabria) a 870 m de altitud.
Con una longitud de 47 km. hasta que en la ciudad de Torrelavega se une al Saja, una de las características más sorprendentes es que lo hace en un recorrido casi rectilíneo.
Su recorrido, de 47 km de longitud es prácticamente rectilíneo en dirección sur-norte atravesando los municipios de Campoo de Enmedio (donde nace), Santiurde de Reinosa, Pesquera, Bárcena de Pie de Concha, Molledo, Arenas de Iguña, Cieza, Los Corrales de Buelna, Cartes y finalmente Torrelavega.